Sa stanovišta fiziologije, autogeni trening omogućava kontrolu procesa uzbuđenja i inhibicije, postizanja njihovog balansiranja. Uz stalnu upotrebu ove tehnike, sposobnost tela da se brzo prilagođava promenljivim uslovima životne sredine povećava se, aktiviraju se mentalni procesi, normalizuje se delovanje nervnog sistema i memorije se poboljšavaju. Od velikog značaja je autogena obuka za uklanjanje sindroma umora, vraćanje normalnog emocionalnog stanja organizma nakon prenosa stresa, za poboljšanje pamćenja i pažnje. U terapeutske svrhe, ova tehnika se koristi za neuroze i druge funkcionalne poremećaje, kao i za normalizaciju rada osnovnih sistema tela i regulaciju metaboličkih procesa.
Autogena obuka je dostupna za studiranje i asimilaciju skoro svakome. Budući da je važnost ove psiho-higijenske tehnike za normalno funkcionisanje tela jednostavno neprocenjiva, a za samu obuku nije potrebna posebna oprema ili simulatori, onda za svakoga ko želi da nauči metode autogene obuke, samo je nekoliko minuta dnevno za takve vežbe. Međutim, čak i tako kratko vreme će biti dovoljno za formiranje sposobnosti da pravilno napne i opuste mišiće, koncentrišu se na izabrani predmet, regulišu emocionalno stanje, održavaju normalno funkcionisanje autonomnog dela nervnog sistema i time nadgledaju funkcionalno stanje unutrašnjih organa.
Glavni deo autogenog treninga je proces autosugestije, u kojem se koriste verbalne forme. Fraze treba izgovarati u imperativnom tonu od prvog jedinstvenog osoblja, tj. Trebalo bi da počnu približno ovako: "Smiren sam ... osećam se uveren ...", itd. U skladu sa pravilima autogenog treninga, u takvim frazama ne treba koristiti česticu "ne", odnosno, umjesto izraza "nisam bolesna", moram reći "Ja sam zdrav", a umjesto "nisam uopšte zabrinut" bolje je reći "ja sam apsolutno smiren". Ovi izrazi moraju se izreći u određenom redosledu. Na početku vježbe fraze treba izgovarati da se opuste i opuste, a zatim fraze koje svrsishodno utiču na tijelo i pomažu u postizanju osnovnih psihoterapijskih zadataka sjednice, a kada se vježba završi, izrazi koji se moraju opustiti i imati mobilizacijski efekat. Sa pravilnim izvršenjem tehnike, osoba pada u stanje svetlosti poludezona, tokom koje se odvija samo-hipnoza samopomoći, što pomaže u održavanju normalnog funkcionisanja tela.
Utvrđeno je da kod različitih tipova emocionalnog stanja postoji povećana napetost jedne ili druge grupe mišića. Na primjer, ako je raspoloženje loše, u mišićima respiratornog sistema se povećava napetost, a sa strahom povećava napetost mišića lica. Zbog toga, postizanje tokom autogenog treninga opuštanja određene muskulature, može se time osigurati normalno funkcionisanje organizma i promjena na bolje njegovo psihološko stanje. Dakle, na osnovu veze između mišićnih grupa i emocionalnog stanja tela, moguće je značajno smanjiti neuro-emocionalno preopterećenje, smanjiti zamor i time promovisati brzu obnavljanje potrebnog nivoa efikasnosti.
Uprkos naizglednoj jednostavnosti autologne obuke i njegove ogromne pozitivne vrednosti za normalno funkcionisanje tela, i dalje postoje neke poteškoće u korišćenju ove tehnike. Na primjer, za djecu mlađu od 12 godina, korištenje autogene obuke često je neefektivno, jer u ovom dobnom periodu još uvijek nije dovoljno svjestan odnos prema sopstvenoj ličnosti. Stariji ljudi mogu takođe imati neke poteškoće u pokušaju da savladaju ovu psiho-higijensku tehniku, s obzirom na to da se uzrast starosti striženih mišića naglo smanjuje, a kontrola relaksacije mišića postaje mnogo teža.